植物工厂是用高科技打造的现代农业可持续生产系统，市场前景可观。但中国农业科都市农业研究所副所长杨其长曾表示：植物工厂的市场需要一个培育的过程，如果民众了解并且认可植物工厂的模式，那其产品自然就会得到认可。不过，植物工厂产出的菜也不会是普通消费者的，“只能是小部分人群的消费品”。

如果仅仅是卖产品，植物工厂的发展难免受限。所以除了植物工厂培育的蔬菜上市销售之外，很多植物工厂也开发了新型商业模式，例如：教育培训、休闲观光、采摘体验等。既能从多模式挖掘用户对植物工厂的不同需求，又可以提升植物工厂的附加值。

郑胤建也表示，就未来商业模式拓展来说，植物工厂除了生产功能之外，在家庭园艺、社区农业、科普教育、设施装备输出等方面也有比较大的需求，比如现在小菜园工程在深圳、广州等地就有一定的发挥空间。

此外，植物工厂本身是一个多技术的集成体，可以做单一技术的辐射化应用。以植物工厂中可调控的环境这套程序和系统为例，它调控精度比较高，可以辐射应用到比它技术门槛低的场景中，如温室大棚。还包括灌溉系统、施肥系统、光源系统等同样如此，单拎出来的单项技术就可以实现价值延伸。

无限未来与现实挑战
当植物工厂完全采用工业化、程序化的生产模式，栽培环境也达到优化时，其生产所具有的短周期、高产量、高品质、高效益的优势是传统农作模式难以望其项背的。虽然未来可期，但是当前植物工厂在发展和推广上仍存在一些“瓶颈”问题。

成本高个拦路虎。商业化植物工厂的成本分为一次性投资、设备折旧、生产管理三个方面。先不说设备折旧和生产管理，单从初始的建设投入来说，这也是一笔不容小觑的投资。

前瞻产业研究院根据我国商业化大型植物工厂（中科三安）的数据计算得出：建设1000平米以下的植物工厂(包括内部装修、设备、设施)，每平米的成本在15000元-20000元之间；建设5000-10000平米的植物工厂，每平米的成本在8000元-10000元；建设10000平米以上的大型植物工厂，建设成本会下降至8000元/平米以下。而这只是高昂的前期投入，后期维护以及能耗成本问题同样明显。